项目提交方在收到审查完成的通知后，可申请办理合格证。审查机构核对项目的审查结果、相关材料的完整性和准确性，确认无误后，按照规定的格式和内容制作合格证。合格证上需注明项目名称、编号、审查机构名称、签发日期等信息，并加盖审查机构的公章。签发过程需严格遵守审批程序，经相关负责人审核批准后，方可将合格证发放给项目提交方。同时，对合格证的签发情况进行登记备案，确保每一份合格证都可追溯。